MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015850	ATC	2	6	225930	225935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780960
4502	NC_015850	CTG	2	6	225985	225990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780960
4503	NC_015850	CAT	2	6	226018	226023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780960
4504	NC_015850	CTG	2	6	226031	226036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780960
4505	NC_015850	ACC	2	6	226037	226042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780960
4506	NC_015850	ACCT	2	8	226070	226077	25 %	25 %	0 %	50 %	340780960
4507	NC_015850	CAA	2	6	226162	226167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340780960
4508	NC_015850	CTG	2	6	226227	226232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780961
4509	NC_015850	GTG	2	6	226248	226253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780961
4510	NC_015850	GC	3	6	226254	226259	0 %	0 %	50 %	50 %	340780961
4511	NC_015850	GAT	2	6	226295	226300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780961
4512	NC_015850	G	6	6	226340	226345	0 %	0 %	100 %	0 %	340780961
4513	NC_015850	GGT	2	6	226361	226366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780961
4514	NC_015850	ACC	2	6	226405	226410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780961
4515	NC_015850	ACCC	2	8	226460	226467	25 %	0 %	0 %	75 %	340780961
4516	NC_015850	A	6	6	226491	226496	100 %	0 %	0 %	0 %	340780961
4517	NC_015850	TCC	2	6	226663	226668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4518	NC_015850	TA	3	6	226683	226688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_015850	CAG	2	6	226715	226720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_015850	TCT	2	6	226727	226732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_015850	CAA	2	6	226757	226762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_015850	TGA	2	6	226804	226809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_015850	CCG	2	6	226819	226824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4524	NC_015850	AAT	2	6	226879	226884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_015850	CAA	2	6	226913	226918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_015850	ATT	2	6	226956	226961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_015850	TAA	2	6	226970	226975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_015850	ACC	2	6	226992	226997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4529	NC_015850	ATT	2	6	227011	227016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_015850	AGT	2	6	227072	227077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780962
4531	NC_015850	TCG	2	6	227130	227135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780962
4532	NC_015850	T	6	6	227204	227209	0 %	100 %	0 %	0 %	340780962
4533	NC_015850	TCA	2	6	227226	227231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780962
4534	NC_015850	AAG	2	6	227239	227244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780962
4535	NC_015850	TTGC	2	8	227350	227357	0 %	50 %	25 %	25 %	340780962
4536	NC_015850	GGA	2	6	227370	227375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780962
4537	NC_015850	T	7	7	227408	227414	0 %	100 %	0 %	0 %	340780962
4538	NC_015850	ATA	2	6	227421	227426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340780962
4539	NC_015850	TCT	2	6	227465	227470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340780962
4540	NC_015850	TGC	2	6	227484	227489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780962
4541	NC_015850	AGGA	2	8	227519	227526	50 %	0 %	50 %	0 %	340780962
4542	NC_015850	CGAT	2	8	227587	227594	25 %	25 %	25 %	25 %	340780962
4543	NC_015850	TCA	2	6	227635	227640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780962
4544	NC_015850	TGC	2	6	227652	227657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780962
4545	NC_015850	TATTT	2	10	227702	227711	20 %	80 %	0 %	0 %	340780962
4546	NC_015850	T	6	6	227739	227744	0 %	100 %	0 %	0 %	340780962
4547	NC_015850	TG	3	6	227753	227758	0 %	50 %	50 %	0 %	340780962
4548	NC_015850	AAT	2	6	227762	227767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340780962
4549	NC_015850	TGC	2	6	227800	227805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780962
4550	NC_015850	AT	3	6	227835	227840	50 %	50 %	0 %	0 %	340780962
4551	NC_015850	TGC	2	6	227855	227860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780962
4552	NC_015850	TTA	2	6	227890	227895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340780962
4553	NC_015850	CAA	2	6	227920	227925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340780962
4554	NC_015850	AAC	2	6	227970	227975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340780962
4555	NC_015850	TGA	2	6	228005	228010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780962
4556	NC_015850	GC	4	8	228051	228058	0 %	0 %	50 %	50 %	340780962
4557	NC_015850	T	7	7	228108	228114	0 %	100 %	0 %	0 %	340780962
4558	NC_015850	AGA	2	6	228167	228172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780962
4559	NC_015850	TCA	2	6	228219	228224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780962
4560	NC_015850	ATA	2	6	228238	228243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340780962
4561	NC_015850	ATT	2	6	228330	228335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340780963
4562	NC_015850	AT	3	6	228354	228359	50 %	50 %	0 %	0 %	340780963
4563	NC_015850	TTG	2	6	228372	228377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340780963
4564	NC_015850	GCG	2	6	228432	228437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780963
4565	NC_015850	TCG	2	6	228489	228494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780963
4566	NC_015850	GAG	2	6	228497	228502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780963
4567	NC_015850	GGA	2	6	228557	228562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780963
4568	NC_015850	GCG	2	6	228574	228579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780963
4569	NC_015850	GAT	2	6	228611	228616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780963
4570	NC_015850	CCT	2	6	228626	228631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780963
4571	NC_015850	TTGG	2	8	228765	228772	0 %	50 %	50 %	0 %	340780963
4572	NC_015850	AAT	2	6	228788	228793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340780963
4573	NC_015850	GCA	2	6	228796	228801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780963
4574	NC_015850	CGC	2	6	228847	228852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780963
4575	NC_015850	CGC	2	6	228897	228902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780963
4576	NC_015850	TGA	2	6	228915	228920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780963
4577	NC_015850	AG	3	6	228922	228927	50 %	0 %	50 %	0 %	340780963
4578	NC_015850	CGA	3	9	228994	229002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780963
4579	NC_015850	CGG	2	6	229003	229008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780963
4580	NC_015850	ACA	2	6	229058	229063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340780964
4581	NC_015850	CGG	2	6	229085	229090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780964
4582	NC_015850	TA	3	6	229139	229144	50 %	50 %	0 %	0 %	340780964
4583	NC_015850	CTA	2	6	229274	229279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780964
4584	NC_015850	AGC	2	6	229375	229380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780964
4585	NC_015850	CAC	2	6	229419	229424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780964
4586	NC_015850	AGGATG	2	12	229426	229437	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	340780964
4587	NC_015850	TCT	2	6	229505	229510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340780964
4588	NC_015850	GCA	2	6	229511	229516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780964
4589	NC_015850	ATT	2	6	229810	229815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_015850	GGC	2	6	229864	229869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_015850	TCC	2	6	229871	229876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4592	NC_015850	GGC	2	6	229983	229988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780965
4593	NC_015850	GGA	2	6	230030	230035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780965
4594	NC_015850	GAG	2	6	230079	230084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780965
4595	NC_015850	GTAGGC	2	12	230085	230096	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	340780965
4596	NC_015850	TGA	2	6	230147	230152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780965
4597	NC_015850	CAT	2	6	230267	230272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780965
4598	NC_015850	TG	3	6	230283	230288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_015850	ATG	2	6	230294	230299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_015850	TCG	2	6	230500	230505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780966
4601	NC_015850	CCG	2	6	230517	230522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780966
4602	NC_015850	GTA	2	6	230530	230535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780966
4603	NC_015850	CAG	2	6	230542	230547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780966
4604	NC_015850	GAA	2	6	230583	230588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780966
4605	NC_015850	TCT	2	6	230676	230681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340780966
4606	NC_015850	A	7	7	230799	230805	100 %	0 %	0 %	0 %	340780966
4607	NC_015850	TC	3	6	230833	230838	0 %	50 %	0 %	50 %	340780966
4608	NC_015850	ATA	2	6	230851	230856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340780966
4609	NC_015850	AG	3	6	230914	230919	50 %	0 %	50 %	0 %	340780966
4610	NC_015850	GTT	2	6	230944	230949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340780966
4611	NC_015850	GCC	2	6	231007	231012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780966
4612	NC_015850	ATC	2	6	231085	231090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780966
4613	NC_015850	AGG	2	6	231191	231196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780966
4614	NC_015850	ATG	2	6	231197	231202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780966
4615	NC_015850	GGTT	2	8	231212	231219	0 %	50 %	50 %	0 %	340780966
4616	NC_015850	CAT	2	6	231302	231307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780967
4617	NC_015850	AGC	2	6	231310	231315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780967
4618	NC_015850	CTA	2	6	231397	231402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_015850	TG	4	8	231414	231421	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_015850	CAT	2	6	231486	231491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_015850	GC	3	6	231511	231516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4622	NC_015850	CGC	2	6	231575	231580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_015850	CAG	2	6	231678	231683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_015850	TGC	2	6	231714	231719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_015850	ACG	2	6	231759	231764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4628	NC_015850	GTG	2	6	231861	231866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4634	NC_015850	AGC	2	6	232101	232106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4642	NC_015850	TGG	2	6	232404	232409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4643	NC_015850	CAC	2	6	232434	232439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4749	NC_015850	GCG	2	6	238098	238103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780970
4750	NC_015850	CCG	2	6	238234	238239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780970
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4754	NC_015850	CGGCAC	2	12	238300	238311	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	340780970
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4865	NC_015850	G	7	7	243198	243204	0 %	0 %	100 %	0 %	340780976
4866	NC_015850	GC	3	6	243275	243280	0 %	0 %	50 %	50 %	340780976
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4992	NC_015850	GTC	2	6	249243	249248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780981
4993	NC_015850	GTC	2	6	249303	249308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780981
4994	NC_015850	GCA	2	6	249371	249376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780981
4995	NC_015850	TCC	2	6	249382	249387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780981
4996	NC_015850	CGAT	2	8	249604	249611	25 %	25 %	25 %	25 %	340780981
4997	NC_015850	CCG	2	6	249687	249692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780981
4998	NC_015850	CCT	2	6	249698	249703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780981
4999	NC_015850	CAG	2	6	249705	249710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780981
5000	NC_015850	CCCG	2	8	249758	249765	0 %	0 %	25 %	75 %	340780981

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